Hoy aprendimos la utilizaciòn de las herraminetas informàticas para encontrar, comparar y estudiar secuencias de ADN o proteìnas.
Buscamos secuencias de los genes de nuestro interès utilizando el sitio http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ que es un banco de datos muy utilizado, done se pueden obtener las secuencias de genes. Nosotros obtuvimos las secuencias de MageA4 y MageA6.
Ambas secuencias fueron comparadas (alineadas) utilizando un programa llamado BLAST 2 seq. http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/bl2seq/wblast2.cgi
A continuaciòn se buscò las enzimas de restricciòn que podìan cortar en ambos genes utilizando el programa Neb cutter http://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php
Este programa realizò el mapa de restricciòn de MageA4 y MageA6 y observamos que a pesar de ser dos genes muy similares, habìa una diferencia en el sitio de corte de la enzima HindIII. Observamos que MageA4 tiene una sola base de diferencia en el sitio de corte de HindIII: la secuencia correcta en MageA6 es AAGCTT, mientras que en MageA4 la secuencia es AAGCCT.
Esta diferencia hace que HindIII corte MageA6 pero no MageA4. Este control se realizò el dia 6.
Buscamos secuencias de los genes de nuestro interès utilizando el sitio http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ que es un banco de datos muy utilizado, done se pueden obtener las secuencias de genes. Nosotros obtuvimos las secuencias de MageA4 y MageA6.
Ambas secuencias fueron comparadas (alineadas) utilizando un programa llamado BLAST 2 seq. http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/bl2seq/wblast2.cgi
A continuaciòn se buscò las enzimas de restricciòn que podìan cortar en ambos genes utilizando el programa Neb cutter http://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php
Este programa realizò el mapa de restricciòn de MageA4 y MageA6 y observamos que a pesar de ser dos genes muy similares, habìa una diferencia en el sitio de corte de la enzima HindIII. Observamos que MageA4 tiene una sola base de diferencia en el sitio de corte de HindIII: la secuencia correcta en MageA6 es AAGCTT, mientras que en MageA4 la secuencia es AAGCCT.
Esta diferencia hace que HindIII corte MageA6 pero no MageA4. Este control se realizò el dia 6.
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